In august 1987, episcopul de Katowice, Damian Zimoń, l-a numit pe pr. Józef Anczok, rectorul capelei și constructorul noii biserici, încredințându-i sarcina de a înființa o parohie independentă în Lisowice. Pr. Józef Anczok, împreună cu credincioșii și cu ajutorul considerabil al pr. Henryk Gajda, preotul paroh, a început să construiască biserica. Noua parohie a fost înființată la 1 ianuarie 1989, iar construcția bisericii a început la mijlocul lunii octombrie 1989. După cinci ani de muncă, pe 26 noiembrie 1994, episcopul de Gliwice Jan Wieczorek solemn după ce a binecuvântat noua biserică din Sf. Ioan din Nepomuk. În 2008, moaștele patronului au fost aduse de la Praga. În 1999 a fost înființat un cimitir parohial la ul. Nou.