Kaplica pw. św. Antoniego z Padwy została ufundowana przez Jerzego Leonarda de Colonna. W latach 1666-1670 prawdopodobnie zbudował ją Marcin Grochowski. Kaplica posiadała murowane sklepienie oraz ołtarz, w którym znajdowała się pozłacana figura patrona. W 1687 roku erygowano parafię w Kotach, a pałacowa kaplica w Tworogu została wówczas podniesiona do rangi kościoła filialnego. W protokole z tegoż roku wizytator, archidiakon Marcin Stephetius zapisał, iż w kaplicy znajdują się trzy ołtarze, w tym główny poświęcony św. Antoniemu. Tworóg nie posiadał wówczas własnego proboszcza. Rezydował tu jedynie duszpasterz tymczasowy. Jako pierwszy przez pół roku funkcję tę sprawował ks. Paweł Mikolcy.
Z czasem kaplicę św. Antoniego w Tworogu stopniowo rozbudowano. Najpierw powstał drewniany przedsionek,a potem zakrystia. Projekt architektoniczny kościoła opracował Krzysztof Worbs. Konsekracja kościoła odbyła się w 1817 roku.
W latach 1905-1907 rozbudowy i przebudowy kościoła w stylu neobarokowym podjął się ks. Karol Knosała. Kościół zyskał nawę poprzeczną oraz nowe prezbiterium, podwyższono wieżę. W środku znalazł się XVII-wieczny ołtarz główny oraz pochodzące z XIX wieku klasycystyczne organy.