W 1980 roku ks. dziekan Wiktor Pielesz zapalił tutejszych mieszkańców do idei budowy kościoła. 15.04.1981 roku kuria diecezjalna w Opolu rozpoczęła starania u władz cywilnych, dotyczące wydania zgody na budowę punktu katechetycznego w Czekanowie. Kamień węgielny do świątyni poświęcił Ojciec Święty Jan Paweł II w czasie pielgrzymki na Górze Św. Anny 21.06.1983 roku. W latach 1984–91 wybudowano w Czekanowie zespół sakralny, obejmujący kościół i dom parafialny. Pierwszą Mszę św. w nowo wybudowanym kościele sprawowano w Pasterkę 24.12.1989 roku. Kościół konsekrował biskup pomocniczy z Opola Jan Bagiński 26 maja 1991 roku, nadając mu za patrona św. Floriana. 14 września 1997 roku wyłączono Czekanów z parafii w Ziemięcicach i dołączono do parafii Matki Boskiej Różańcowej w Grzybowicach. Przez wiele lat posługę duszpasterską w Czekanowie pełnił ks. proboszcz Marian Krojenka z Grzybowic. Biskup Gliwicki Jan Wieczorek, dekretem z dnia 7.10.2009 roku, erygował samodzielną placówkę duszpasterską w Czekanowie, nadając jej status samodzielnej parafii.